Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms