Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CenpjQ569L8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CenpjQ569L8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpjQ569L8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpjQ569L8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpjQ569L8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpjQ569L8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpjQ569L8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpjQ569L8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpjQ569L8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpjQ569L8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpjQ569L8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpjQ569L8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpjQ569L8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpjQ569L8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpjQ569L8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpjQ569L8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpjQ569L8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CenpjQ569L8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CenpjQ569L8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms