Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms