Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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