Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc47Q505F5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc47Q505F5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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