Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms