Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc110Q3V125 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms