Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms