Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms