Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm28047Q3US59 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms