Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR50

Vwa5b2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b2Q3UR50 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vwa5b2Q3UR50 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms