Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgef40Q3UPH7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
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