Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog7Q3UM29 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms