Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsg1Q3UM18 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms