Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mccc2Q3ULD5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mccc2Q3ULD5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mccc2Q3ULD5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mccc2Q3ULD5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mccc2Q3ULD5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mccc2Q3ULD5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mccc2Q3ULD5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mccc2Q3ULD5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mccc2Q3ULD5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mccc2Q3ULD5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mccc2Q3ULD5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mccc2Q3ULD5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mccc2Q3ULD5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms