Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc61Q3UJV1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms