Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Sf3b2Q3UJB0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms