Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms