Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHJ8

Rnf44, RING finger protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf44Q3UHJ8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms