Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LchnQ3UHG7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LchnQ3UHG7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LchnQ3UHG7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LchnQ3UHG7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LchnQ3UHG7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LchnQ3UHG7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LchnQ3UHG7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LchnQ3UHG7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LchnQ3UHG7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LchnQ3UHG7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LchnQ3UHG7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LchnQ3UHG7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LchnQ3UHG7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LchnQ3UHG7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LchnQ3UHG7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LchnQ3UHG7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LchnQ3UHG7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms