Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc58Q3UGP9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms