Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Puf60Q3UEB3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms