Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms