Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U6N9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U6N9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U6N9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U6N9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U6N9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U6N9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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