Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms