Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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