Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3TTL0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTL0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTL0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTL0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3TTL0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3TTL0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTL0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms