Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ctdnep1Q3TP92 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ctdnep1Q3TP92 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ctdnep1Q3TP92 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctdnep1Q3TP92 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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