Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc13Q3TIR1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms