Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp444Q3TDV8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Zfp444Q3TDV8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Zfp444Q3TDV8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp444Q3TDV8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp444Q3TDV8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp444Q3TDV8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp444Q3TDV8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp444Q3TDV8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp444Q3TDV8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp444Q3TDV8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp444Q3TDV8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp444Q3TDV8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms