Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
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Shroom4Q1W617 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Shroom4Q1W617 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Shroom4Q1W617 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Shroom4Q1W617 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Shroom4Q1W617 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
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Shroom4Q1W617 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Shroom4Q1W617 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Shroom4Q1W617 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Shroom4Q1W617 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Shroom4Q1W617 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Shroom4Q1W617 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Shroom4Q1W617 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
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