Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rpusd3Q14AI6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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