Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtel1Q0VGM9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtel1Q0VGM9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtel1Q0VGM9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtel1Q0VGM9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtel1Q0VGM9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtel1Q0VGM9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtel1Q0VGM9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtel1Q0VGM9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtel1Q0VGM9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtel1Q0VGM9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtel1Q0VGM9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtel1Q0VGM9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtel1Q0VGM9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtel1Q0VGM9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtel1Q0VGM9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtel1Q0VGM9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtel1Q0VGM9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtel1Q0VGM9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtel1Q0VGM9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtel1Q0VGM9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtel1Q0VGM9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtel1Q0VGM9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtel1Q0VGM9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtel1Q0VGM9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtel1Q0VGM9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtel1Q0VGM9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtel1Q0VGM9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtel1Q0VGM9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtel1Q0VGM9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtel1Q0VGM9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtel1Q0VGM9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtel1Q0VGM9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtel1Q0VGM9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtel1Q0VGM9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms