Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms