Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Samd12Q0VE29 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Samd12Q0VE29 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samd12Q0VE29 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Samd12Q0VE29 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Samd12Q0VE29 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samd12Q0VE29 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms