Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
StumQ0VBF8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms