Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms