Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttc21bQ0HA38 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms