Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms