Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc4Q08624 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms