Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SctQ08535 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SctQ08535 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SctQ08535 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SctQ08535 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SctQ08535 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SctQ08535 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SctQ08535 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SctQ08535 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SctQ08535 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SctQ08535 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SctQ08535 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SctQ08535 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SctQ08535 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SctQ08535 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SctQ08535 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SctQ08535 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SctQ08535 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SctQ08535 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SctQ08535 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SctQ08535 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SctQ08535 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SctQ08535 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SctQ08535 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SctQ08535 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SctQ08535 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SctQ08535 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SctQ08535 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SctQ08535 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SctQ08535 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SctQ08535 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SctQ08535 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SctQ08535 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SctQ08535 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SctQ08535 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SctQ08535 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SctQ08535 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SctQ08535 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SctQ08535 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SctQ08535 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SctQ08535 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SctQ08535 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SctQ08535 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SctQ08535 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SctQ08535 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SctQ08535 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SctQ08535 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SctQ08535 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SctQ08535 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SctQ08535 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SctQ08535 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SctQ08535 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SctQ08535 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SctQ08535 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SctQ08535 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SctQ08535 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SctQ08535 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SctQ08535 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SctQ08535 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SctQ08535 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SctQ08535 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SctQ08535 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SctQ08535 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SctQ08535 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SctQ08535 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SctQ08535 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SctQ08535 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SctQ08535 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SctQ08535 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SctQ08535 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SctQ08535 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SctQ08535 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SctQ08535 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SctQ08535 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SctQ08535 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SctQ08535 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SctQ08535 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SctQ08535 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SctQ08535 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SctQ08535 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SctQ08535 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SctQ08535 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SctQ08535 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SctQ08535 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SctQ08535 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SctQ08535 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SctQ08535 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SctQ08535 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SctQ08535 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SctQ08535 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SctQ08535 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SctQ08535 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SctQ08535 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SctQ08535 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SctQ08535 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SctQ08535 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SctQ08535 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SctQ08535 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SctQ08535 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SctQ08535 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms