Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms