Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms