Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprgQ05909 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprgQ05909 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprgQ05909 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprgQ05909 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprgQ05909 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PtprgQ05909 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms