Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarcad1Q04692 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms