Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1sQ02789 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms