Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GscQ02591 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GscQ02591 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GscQ02591 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GscQ02591 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GscQ02591 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GscQ02591 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GscQ02591 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GscQ02591 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GscQ02591 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GscQ02591 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GscQ02591 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GscQ02591 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GscQ02591 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GscQ02591 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GscQ02591 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GscQ02591 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GscQ02591 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GscQ02591 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GscQ02591 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GscQ02591 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GscQ02591 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GscQ02591 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GscQ02591 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GscQ02591 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GscQ02591 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GscQ02591 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GscQ02591 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GscQ02591 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GscQ02591 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GscQ02591 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GscQ02591 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GscQ02591 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GscQ02591 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GscQ02591 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GscQ02591 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GscQ02591 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GscQ02591 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GscQ02591 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GscQ02591 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GscQ02591 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GscQ02591 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GscQ02591 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GscQ02591 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GscQ02591 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GscQ02591 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GscQ02591 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GscQ02591 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GscQ02591 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GscQ02591 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GscQ02591 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GscQ02591 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GscQ02591 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GscQ02591 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GscQ02591 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GscQ02591 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GscQ02591 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GscQ02591 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GscQ02591 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GscQ02591 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GscQ02591 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GscQ02591 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GscQ02591 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GscQ02591 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GscQ02591 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GscQ02591 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GscQ02591 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GscQ02591 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GscQ02591 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GscQ02591 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GscQ02591 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GscQ02591 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GscQ02591 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GscQ02591 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GscQ02591 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GscQ02591 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GscQ02591 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GscQ02591 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GscQ02591 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GscQ02591 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GscQ02591 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GscQ02591 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GscQ02591 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GscQ02591 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GscQ02591 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GscQ02591 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GscQ02591 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GscQ02591 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GscQ02591 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GscQ02591 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GscQ02591 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GscQ02591 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GscQ02591 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GscQ02591 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GscQ02591 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GscQ02591 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GscQ02591 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GscQ02591 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GscQ02591 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GscQ02591 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms