Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms