Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VcpQ01853 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VcpQ01853 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VcpQ01853 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VcpQ01853 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VcpQ01853 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VcpQ01853 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VcpQ01853 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VcpQ01853 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VcpQ01853 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms