Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms