Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms